Applications of high-throughput genotyping in apple (Malus domestica Borkh.): pedigree reconstruction and genome-wide association studies in the context of cider apple

Abstract

El manzano doméstico (Malus domestica Borkh.) es uno de los cultivos frutales más extendidos, sobre todo en las regiones templadas. Favorecida por su importancia social y económica, la mejora genética del manzano ha sido, y sigue siendo, un objetivo importante. Si bien el desarrollo de nuevas variedades mediante cruzamientos biparentales es una labor larga y tediosa en esta especie, el proceso de mejora puede acelerarse cuando se conocen las bases genéticas de las variaciones fenotípicas. Una de las estrategias a utilizar en la identificación de estas variantes son los estudios de asociación de genoma completo (GWAS). Su capacidad para investigar la correlación entre los polimorfismos de nucleótido único (SNPs) y el fenotipo, utilizando individuos no emparentados, ha sido aplicada en varias especies. En árboles leñosos como el manzano, los GWAS se llevan a cabo utilizando colecciones de campo. El genotipado de estos bancos de germoplasma también es crucial para avanzar en el análisis de la diversidad y la reconstrucción del pedigrí de las variedades de manzano.