Estudio y seguimiento de tumores raros y hematológicos mediante el empleo de técnicas de secuenciación masiva
Author:
Centro/Departamento/Otros:
Subject:
Cáncer
SpliceXeq
Mutaciones genómicas
Publication date:
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Abstract:
El establecimiento de grandes consorcios internacionales para la secuenciación de los genomas del cáncer ha permitido que en la última década se hayan identificado las principales alteraciones moleculares presentes en los tipos de tumores más frecuentes. Esto ha proporcionado una visión global acerca de los mecanismos clave asociados con el proceso oncogénico. Sin embargo, aún es necesario estudiar en detalle el impacto biológico de mutaciones en regiones de ADN no codificante y analizar otros tipos tumorales con baja incidencia en la población para implantar métodos de diagnóstico precoz y tratamientos específicos con alta relevancia clínica. Durante la presente tesis doctoral, se ha desarrollado una herramienta llamada SpliceXeq, que integra datos de secuenciación de ADN y ARN para identificar de forma sistemática mutaciones somáticas que provocan la activación de sitios de splicing aberrantes. La aplicación de SpliceXeq sobre una cohorte de más de cien mil mutaciones genómicas detectadas en leucemia linfática crónica (CLL), ha permitido identificar una mutación recurrente (c.99G>T) en MAP3K14, un regulador central y específico de la vía de señalización de NF-ᴋB no canónica.
El establecimiento de grandes consorcios internacionales para la secuenciación de los genomas del cáncer ha permitido que en la última década se hayan identificado las principales alteraciones moleculares presentes en los tipos de tumores más frecuentes. Esto ha proporcionado una visión global acerca de los mecanismos clave asociados con el proceso oncogénico. Sin embargo, aún es necesario estudiar en detalle el impacto biológico de mutaciones en regiones de ADN no codificante y analizar otros tipos tumorales con baja incidencia en la población para implantar métodos de diagnóstico precoz y tratamientos específicos con alta relevancia clínica. Durante la presente tesis doctoral, se ha desarrollado una herramienta llamada SpliceXeq, que integra datos de secuenciación de ADN y ARN para identificar de forma sistemática mutaciones somáticas que provocan la activación de sitios de splicing aberrantes. La aplicación de SpliceXeq sobre una cohorte de más de cien mil mutaciones genómicas detectadas en leucemia linfática crónica (CLL), ha permitido identificar una mutación recurrente (c.99G>T) en MAP3K14, un regulador central y específico de la vía de señalización de NF-ᴋB no canónica.
Local Notes:
DT(SE) 2023-020
Collections
- Tesis [7486]