Aplicación de estrategias basadas en la secuenciación de genomas para la activación de la producción de nuevos compuestos bioactivos en Streptomyces spp

Abstract

En los últimos años, debido al aumento de las resistencias bacterianas a antibióticos y a la necesidad de compuestos antitumorales nuevos, más efectivos y específicos, sumado a la baja eficacia de los métodos de escrutinio tradicionales, se ha hecho necesario el desarrollo de nuevas estrategias para la búsqueda de nuevos compuestos bioactivos. Los Actinomicetos son el grupo de bacterias más importante en la síntesis de compuestos bioactivos de origen microbiano, con un 5-10 % de su genoma dedicado al metabolismo secundario, y dentro de éstos, Streptomyces es el género de mayor peso, ya que supone un 75 % de la producción. La secuenciación de genomas ha puesto de manifiesto su potencial productor, ya que contienen un elevado número de agrupamientos génicos destinados al metabolismo secundario, superior al número de metabolitos detectados en condiciones experimentales. La minería genómica trata de descubrir nuevos compuestos utilizando estrategias bioinformáticas y de ingeniería genética para identificar o inducir la expresión de estos agrupamientos silenciosos o crípticos. Las halogenasas son enzimas de “decoración” que incorporan halógenos a gran variedad de compuestos generando diversidad de actividad y de estructuras. Además, el halógeno es importante para la biodisponibilidad y actividad biológica de estos compuestos, porque aumenta la estabilidad, efectividad y especificidad. Por tanto, el uso de genes que codifican halogenasas como marcadores de nuevos clústeres de interés es una estrategia interesante para la búsqueda de nuevos compuestos bioactivos.