Cambios de metilación e hidroximetilación del ADN durante el envejecimiento de células madre mesenquimales humanas
Other title:
DNA methylation and hydroxymethylation changes during aging in human mesenchymal stem cells
Author:
Centro/Departamento/Otros:
Subject:
Investigación en cáncer
Epidemiología
Biología molecular
Cultivo celular
Envejecimiento somático
Publication date:
Descripción física:
Abstract:
Esta tesis doctoral tiene como propósito describir los cambios de metilación e hidroximetilación del ADN que tienen lugar a lo largo de la vida de células madre mesenquimales, su relación entre sí y su asociación con las diferentes marcas post-traduccionales de histonas. Para ello, en primer lugar estudiamos los cambios de metilación del ADN en muestras obtenidas de individuos de diferentes edades, donde mediante arrays de metilación, identificamos una hipometilació global con la edad, asociada a la marca activación de histonas H3K4me1 en MSCs. Posteriormente, estudiamos la 5hmC en MSCs, la cual vimos que estaba asociada a regiones de baja densidad de CpGs, intrones, enhancers y a la H3k4me1. Además, se encontró que el aumento de 5hmC asociado a la pérdida de metilación con la edad en MSCs. Por último, durante el desarrollo de esta tesis doctoral se ha puesto a punto el desarrollo de una técnica que permite el análisis de la 5hmC mediante la pirosecuenciación del ADN en regiones específicas.
Esta tesis doctoral tiene como propósito describir los cambios de metilación e hidroximetilación del ADN que tienen lugar a lo largo de la vida de células madre mesenquimales, su relación entre sí y su asociación con las diferentes marcas post-traduccionales de histonas. Para ello, en primer lugar estudiamos los cambios de metilación del ADN en muestras obtenidas de individuos de diferentes edades, donde mediante arrays de metilación, identificamos una hipometilació global con la edad, asociada a la marca activación de histonas H3K4me1 en MSCs. Posteriormente, estudiamos la 5hmC en MSCs, la cual vimos que estaba asociada a regiones de baja densidad de CpGs, intrones, enhancers y a la H3k4me1. Además, se encontró que el aumento de 5hmC asociado a la pérdida de metilación con la edad en MSCs. Por último, durante el desarrollo de esta tesis doctoral se ha puesto a punto el desarrollo de una técnica que permite el análisis de la 5hmC mediante la pirosecuenciación del ADN en regiones específicas.
Local Notes:
DT(SE) 2016-141
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