Espectro Mutacional del Gen NOTCH3 en pacientes de CADASIL
Author:
Director:
Subject:
Genética
CADASIL
CARASIL
Publication date:
Serie:
Máster Universitario en Biomedicina y Oncología Molecular
Abstract:
El objetivo del presente Trabajo Fin de Máster era desarrollar un procedimiento de secuenciación masiva (Next Generation Sequencing, NGS) para buscar mutaciones en los genes NOTCH3 y HTRA1 en pacientes con características clínicas de CADASIL. Un total de 80 pacientes fueron secuenciados mediante chips semiconductores en un aparato Ion Torrent Personal Genome Machine. Las posibles mutaciones encontradas fueron confirmadas mediante secuenciación Sanger en los pacientes correspondientes. Seis pacientes presentaban una mutación de cambio de cisteína, una alteración muy común en pacientes de CADASIL. Sin embargo, se encontraron dos variantes no descritas en el gen NOTCH3 (p.Cys1250Trp y p.Pro2178Ser) y dos variantes en el gen HTRA1 (p.Ser139Ala y p.Arg670Gln), de las cuáles únicamente la variante de exón 23 del gen NOTCH3 (p.Cys1250Trp) parece tener carácter patogénico. El procedimiento de NGS aquí descrito podría facilitar un screening más rápido y a menor coste de largas cohortes de pacientes de CADASIL.
El objetivo del presente Trabajo Fin de Máster era desarrollar un procedimiento de secuenciación masiva (Next Generation Sequencing, NGS) para buscar mutaciones en los genes NOTCH3 y HTRA1 en pacientes con características clínicas de CADASIL. Un total de 80 pacientes fueron secuenciados mediante chips semiconductores en un aparato Ion Torrent Personal Genome Machine. Las posibles mutaciones encontradas fueron confirmadas mediante secuenciación Sanger en los pacientes correspondientes. Seis pacientes presentaban una mutación de cambio de cisteína, una alteración muy común en pacientes de CADASIL. Sin embargo, se encontraron dos variantes no descritas en el gen NOTCH3 (p.Cys1250Trp y p.Pro2178Ser) y dos variantes en el gen HTRA1 (p.Ser139Ala y p.Arg670Gln), de las cuáles únicamente la variante de exón 23 del gen NOTCH3 (p.Cys1250Trp) parece tener carácter patogénico. El procedimiento de NGS aquí descrito podría facilitar un screening más rápido y a menor coste de largas cohortes de pacientes de CADASIL.
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