Caracterización genómica, expresión génica y evolución molecular de la anexina A13
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Se han obtenido y caracterizado los cDNAs de la anexina A13 de ratón y los correspondientes a la isoformas a y b de la anexina A13 humana. También se identificaron otros cdnas de los genes ortólogos en otras especies incluyendo las de rata, vaca y peces teleósteos. Estos cDNAs fueron utilizados en la caracterización de los genes, tanto por procedimientos clásicos como por los del análisis bioinformático de secuencias genómicas depositadas en las bases de datos de dominio público. El análisis comparativo de la estructura de los genes caracterizados nos ha permitido comprobar que en peces teleósteos existen dos copias del gen y que el tamaño del mismo es mucho menor en los genomas de telósteos analizados que en los de mamíferos. Además las copias del gen en teleósteos parecen haber seguido un proceso de evolución divergente más acusado en las regiones reguladoras que en las codificantes. Es sorprendente no haber encontrado un exón equivalente al exón alternativo humano en ninguna de las especies analizadas aunque hemos encontrado una secuencia vagamente similar en los genes de ratón y rata que nos hace sospechar que en roedores se ha perdido el mencionado exón y actualmente se encuentra en proceso de desaparación en el genoma. La subfamilia de la anexina A13 presenta un patrón de "splicing" único dentro de la familia a de las anexinas. El refinamiento de los análisis de evolución molecular mediante la inclusión de secuencias de anexina A13 procedentes de especies tempranamente divergentes nos ha permitido confirmar que la anexina A13 es la anexina de vertebrados filogenéticamente más antigua. Estos análisis avalan la hipótesis de una evolución secuencial y progresiva de todas las anexinias de vertebrados a partir de un progenitor ancestral común y se sugiere a la anexina A13 como fundador dela familia seguido de las anexinas A7 y A11 [...]
Se han obtenido y caracterizado los cDNAs de la anexina A13 de ratón y los correspondientes a la isoformas a y b de la anexina A13 humana. También se identificaron otros cdnas de los genes ortólogos en otras especies incluyendo las de rata, vaca y peces teleósteos. Estos cDNAs fueron utilizados en la caracterización de los genes, tanto por procedimientos clásicos como por los del análisis bioinformático de secuencias genómicas depositadas en las bases de datos de dominio público. El análisis comparativo de la estructura de los genes caracterizados nos ha permitido comprobar que en peces teleósteos existen dos copias del gen y que el tamaño del mismo es mucho menor en los genomas de telósteos analizados que en los de mamíferos. Además las copias del gen en teleósteos parecen haber seguido un proceso de evolución divergente más acusado en las regiones reguladoras que en las codificantes. Es sorprendente no haber encontrado un exón equivalente al exón alternativo humano en ninguna de las especies analizadas aunque hemos encontrado una secuencia vagamente similar en los genes de ratón y rata que nos hace sospechar que en roedores se ha perdido el mencionado exón y actualmente se encuentra en proceso de desaparación en el genoma. La subfamilia de la anexina A13 presenta un patrón de "splicing" único dentro de la familia a de las anexinas. El refinamiento de los análisis de evolución molecular mediante la inclusión de secuencias de anexina A13 procedentes de especies tempranamente divergentes nos ha permitido confirmar que la anexina A13 es la anexina de vertebrados filogenéticamente más antigua. Estos análisis avalan la hipótesis de una evolución secuencial y progresiva de todas las anexinias de vertebrados a partir de un progenitor ancestral común y se sugiere a la anexina A13 como fundador dela familia seguido de las anexinas A7 y A11 [...]
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Tesis 2002-098
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