Organización genómica del aislado AST/89 del virus de la enfermedad hemorrágica de los conejos

Abstract

El virus de la enfermedad hemorrágica de los conejos (RHDV) es el agente causal de una enfermedad altamente contagiosa (enfermedad hemorrágica vírica del conejo), la cual surgió por primera vez en China durante el año 1984, desde donde se extendió a lo largo de América, África y Europa. La caracterización a nivel proteico del RHDV AST/89 permitió realizar la asignación definitiva de este virus a la familia Caliciviridae. Las partículas virales están formadas por un único polipéptido, cuya masa molecular es de aproximadamente 60 kDa (VP60). El material genético extraído de los viriones está formado por dos especies de RNA monocatenario, infectivo, de polaridad positiva, poliadenilado de 7,5 kb y 2,2 kb. El RNA subgenómico de 2,2 kb es coterminal por su extremo 3' con el RNA genómico y su función biológica es la codificación de la VP60. Los experimentos planteados en este trabajo van dirigidos al estudio de la organización genómica y de las estrategias de expresión génica utilizadas por este virus para completar con éxito su ciclo infectivo. El RNA genómico del RHDV AST/89 consiste en 7437 NT excluyendo la cola de poli-A. En este RNA se detectaron dos posibles pautas abiertas de lectura (ORFS): LA ORF1 que abarca el 94% de la longitud global del genoma y tiene capacidad para codificar un polipéptido de 256 kDa y la ORF2 localizada cerca del extremo 3' del RNA genómico con capacidad para codificar una hipotética proteína de 13 kDa. El polipéptido derivado de la ORF1 presenta tres regiones de homología significativa a los péptidos 2C, 3C Y 3D de picornavirus con funciones de RNA helicasa, cisteín proteasa y RNA polimerasa RNA dependiente, respectivamente. La región carboxilo terminal de este polipéptido contiene la secuencia codificadora de la VP60. Se ha demostrado tanto in vitro como en E. coli que la región genómica que presenta homología con el péptido 3C de picornavirus codifica una cisteín proteasa.