Desarrollo de un método bioinformático de tratamiento de datos de señales transitorias multielementales para espectrometría de masas

Abstract

El análisis de células individuales es un tema de investigación en auge, ya que detectar diferencias a nivel de las células individuales permiten diferenciar pequeñas poblaciones celulares que se comportan de forma diferente a la población global. Este hecho puede tener importantes implicaciones en estudios bioquímicos, biotecnológicos, clínicos, farmacológicos, etc. Aunque la técnica más común de análisis de células individuales es la citometría de flujo, en los últimos años han aparecido nuevas técnicas analíticas con capacidad para llevar a cabo esta tarea y, en concreto, la espectrometría de masas con fuente de ionización de plasma por acoplamiento inductivo (ICP-MS) ha surgido como una alternativa adecuada para el análisis del contenido elemental en células individuales en la forma de single-cell ICP-MS (SC-ICP-MS). La novedosa técnica de citometría de masas se basa en los mismos fundamentos que el SC-ICP-MS con el uso de un detector multielemental. En combinación con el uso de marcas metálicas adecuadas, la citometría de masas permite la detección simultánea de decenas de marcadores en cada célula individual. Este tipo de técnicas generan una gran cantidad de datos complejos, que hacen necesario el desarrollo de nuevas herramientas bioinformáticas que permitan su procesamiento y visualización para extraer las conclusiones necesarias a partir de ellos. Los objetivos de este TFG serán, en primer lugar, familiarizar al estudiante con las técnicas de análisis elemental de células individuales para que, desde el conocimiento de los fundamentos de la técnica, pueda desarrollar, a continuación, una herramienta bioinformática que facilite el procesamiento de los datos obtenidos mediante la técnica de single cell-ICP-MS y citometría de masas y su representación gráfica siguiendo los algoritmos y estándares más utilizados por la comunidad científica.