Cambios en el perfil proteómico nuclear en respuesta a estrés UV-B
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Director(es):
Palabra(s) clave:
PROTEOMICA
Fecha de publicación:
Serie:
Máster Universitario en Biotecnología Aplicada a la Conservación y Gestión Sostenible de Recursos Vegetables
Descripción física:
Resumen:
La producción vegetal se ve afectada por el constante incremento en la cantidad de radiación UV-B que llega a la superficie terrestre. Este hecho es de especial importancia en aquellas especies con ciclos de producción muy largos, como son las plantaciones forestales. La planificación de las plantaciones en función de los modelos de cambio climático es clave para garantizar el abastecimiento de recursos madereros en el futuro. En este contexto, se plantea el estudio de los cambios del proteoma nuclear en la especie de interés económico Pinus radiata como un primer paso para describir los procesos de regulación inducidos por exceso de radiación UV-B. Con este propósito, se irradiaron plantas aplicando un índice UV13 durante 2 y 16 horas. El proteoma se analizó empleando una estrategia basada en nUPLC y espectrofotometría de masas (MS-Orbitrap) que permitió identificar un total de 867 proteínas. Mediante la combinación de bases de datos fue posible anotar 470 proteínas. Esta aproximación permitió definir 93 proteínas de expresión diferencial entre los distintos tratamientos realizados, de las que 44 estaban anotadas conociéndose sus características funcionales y/o estructurales. Las familias proteicas más destacadas que modificaron su expresión han sido PROTEÍNA RIBOSOMAL L11, CATALASAS, factor de elongación TU e HISTONAS. Este conjunto de proteínas forman parte de la maquinaria que la planta pone en marcha en respuesta al estrés al que es sometida, bien sean directamente frente a UV-B o parte del mecanismo de protección frente al daño oxidativo causado indirectamente. Se plantea el estudio en mayor profundidad para poder caracterizar una mayor cantidad de proteínas y completar la información obtenida en a partir de este ensayo.
La producción vegetal se ve afectada por el constante incremento en la cantidad de radiación UV-B que llega a la superficie terrestre. Este hecho es de especial importancia en aquellas especies con ciclos de producción muy largos, como son las plantaciones forestales. La planificación de las plantaciones en función de los modelos de cambio climático es clave para garantizar el abastecimiento de recursos madereros en el futuro. En este contexto, se plantea el estudio de los cambios del proteoma nuclear en la especie de interés económico Pinus radiata como un primer paso para describir los procesos de regulación inducidos por exceso de radiación UV-B. Con este propósito, se irradiaron plantas aplicando un índice UV13 durante 2 y 16 horas. El proteoma se analizó empleando una estrategia basada en nUPLC y espectrofotometría de masas (MS-Orbitrap) que permitió identificar un total de 867 proteínas. Mediante la combinación de bases de datos fue posible anotar 470 proteínas. Esta aproximación permitió definir 93 proteínas de expresión diferencial entre los distintos tratamientos realizados, de las que 44 estaban anotadas conociéndose sus características funcionales y/o estructurales. Las familias proteicas más destacadas que modificaron su expresión han sido PROTEÍNA RIBOSOMAL L11, CATALASAS, factor de elongación TU e HISTONAS. Este conjunto de proteínas forman parte de la maquinaria que la planta pone en marcha en respuesta al estrés al que es sometida, bien sean directamente frente a UV-B o parte del mecanismo de protección frente al daño oxidativo causado indirectamente. Se plantea el estudio en mayor profundidad para poder caracterizar una mayor cantidad de proteínas y completar la información obtenida en a partir de este ensayo.
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