DNA-methylation reprogramming in colon cancer cells through epigenetic editing tools

Abstract

En esta tesis doctoral, realizamos un análisis integrativo multi-ómico con el fin de identificar genes candidatos cuya metilación presentase una fuerte correlación con la represión de su expresión génica en muestras de CCR humano y en un conjunto de líneas celulares de cáncer de colorrectal. Además, para facilitar su validación experimental con una demostración de causalidad, recurrimos a novedosas herramientas de edición del epigenoma basadas en el sistema CRISPR/Cas9, como dCas9-TET1 y su mutante inactivo dCas9-TET-IM, dirigidos a través de una biblioteca personalizada de ARNg para modular selectivamente el estado de metilación del ADN de los promotores seleccionados por su fuerte relación con la represión epigenética en CCR, monitorizando las posibles consecuencias funcionales de esta pérdida de metilación del ADN mediante ensayos de proliferación celular.